Můžete podat odpor spolu s žádostí o prominutí zmeškání úkonu (§ 41 správního řádu). Pokud možno co nejdřív, ale v každém případě nejpozději 8 dní od okamžiku, kdy jste se s příkazem fakticky seznámil.
Budete muset popsat okolnosti, které vám znemožnily úkon učinit včas. A rovnou je i prokázat - předložením nebo alespoň navržením důkazů. Chce to pokud možno neprůstřelný příběh, ideálně kombinaci pobytu v zahraničí (to jistě nebude problém prokázat) a nějaké nečekané události, která zabránila dopis včas vyzvednout osobám, kteří vám v místě trvalého pobytu v ČR (který jste, jak předpokládám, nezrušil) poštu monitorují - vzhledem k tomu, že jste zřejmě skutečně dostal příkaz do ruky pozdě na podání odporu, mělo by postačit vhodným způsobem popsat realitu.
Nemusí to vyjít, ale za pokus nic nedáte.