Technicky: Daňově tam problém není, jak už správně uvedli předřečníci. Nevadí-li SJM, tak není problém, abyste společně s manželkou darovali 1/3 podíl na předmětné nemovitosti dceři, ta pak bude vlastníkem 1/3 podílu a zbývající 2/3 zůstanou v SJM. Pokud byste chtěli zrušit i SJM a převést ho na podíly, tak se musíte buď rozvést, nebo smluvně rozsah SJM o danou nemovitost zúžit (§ 716 an. OZ, je třeba forma notářského zápisu). I když SJM a podílové spoluvlastnictví představuje různý režim a v dost aspektech se liší, z praktického hlediska je to podobné - v obou případech „společníci“ věc společně spravují a každému v zásadě náleží 1/2 požitků z ní plynoucích. Podstupovat opičárnu s notářem, zápisem do KN atp. jen kvůli transformaci na podíly nedává prakticky moc smysl, i když technicky to lze.
Ideově: Předpokládám, že důvody zamýšlené transakce máte dobře rozmyšlené, a o nevyžádané rady či konzultace v tomto směru nestojíte. Proto jen obecná poznámka - jakékoliv majetkové společenství je potenciálním zdrojem neřešitelných problémů, a v rámci rodiny či mezi generacemi to platí dvojnásob.
Edit: Neaktualizoval jsem si vlákno, tak koukám, že už jen nosím dříví do lesa. Tak snad jen k poznámce, že notář není zadarmo - to ale není ani ten blbý zápis do KN a náklady s tím spojené (ověřování podpisů na listinách kvůli jejich vkladu do KN atd.). Řádově jsou náklady na notáře s poplatky státu srovnatelné, zejména když teď má katastr podražit na dvojnásobek.